Условия работы школы в период войны были очень тяжелыми. Миллионы советских детей на временно оккупированных территориях вообще не учились. В тылу число учащихся увеличилось за счет эвакуированных детей. Большинство школ работало в две-три смены, не хватало учебников, тетрадей, учебных пособий. В стране численность учащихся 5-10-х классов сократилась в 2-2,5 раза. Было закрыто свыше 6 тысяч средних школ. Центральной задачей было обеспечение всеобуча. Несмотря на громадные расходы на нужды фронта, за 1941-1945 годы в стране было построено и введено в действие больше 8 тысяч школ и восстановлено, отремонтировано и приспособлено для занятий свыше 9 тысяч школ. Во время войны более 1 млн. детей или потеряли или временно лишились своих родителей. Широко развернулось движение за усыновление осиротевших детей. К 1945 году в стране работало 6 тысяч детских домов. В 1943 году были учреждены Суворовские военные училища, Нахимовские военно-морские училища.
Основной контингент учащихся составляли ученики младших классов. Большинство детей старшего школьного возраста вместе с взрослыми трудились на фабриках и заводах или учились в ремесленных училищах и школах ФЗО, которые готовили кадры для народного хозяйства.
Забота государства об охвате обучением всех детей и подростков, которые по разным причинам прекратили посещение школы, выразилась в организации новых видов учебно-воспитательных заведений. С 1 сентября 1943 года стали функционировать школы рабочей молодежи (ШРМ). Осенью следующего года были образованы подобные школы для сельской молодежи (ШСМ).
Впервые такие школы были созданы в Ленинграде зимой 1941-1942 годов. В годы блокады у ленинградских учащихся не было чернил, не хватало бумаги, помещение не отапливалось, а полуголодные подростки продолжали заниматься после работы.
По решению Ленгорсовета в декабре 1942 года в городе открылись 52 школы рабочей молодежи. Некоторые школы находились у самой линии фронта. Решением Ленгорисполкома с 1 сентября 11943 года учащиеся вечерних школ в дни занятий стали получать дополнительно 50, а потом 100 г хлеба, 7 г. жира и 300 г. овощей.
Школы рабочей молодежи, возникнув по всей стране в годы войны, сыграли важную роль в повышении образовательного уровня и подготовке кадров квалифицированных рабочих.
В условиях войны были пересмотрены учебные программы, скорректированы учебные планы. Некоторые предметы (рисование, пение) могли временно исключаться из учебных планов, в которых увеличивалось число часов на русский язык литературу и математику. По постановлению ГКО о Всеобщем обучении с сентября 1941 года в школах была начата военно-допрызывная подготовка учащихся старших, а в 1942-43 учебном году введен новый предмет - военное дело.
С 1943-1944 учебного года в городских школах было введено раздельное обучение, охватившее около 20 % школ страны. Особое внимание уделялось укреплению дисциплины организованности школьников. Этому способствовало введение в 1944 году "Правил для учащихся". В 1944-45 учебном году был осуществлен переход к обучению детей в общеобразовательных школах с 7-летнего возраста, а также были введены экзамены на аттестат зрелости, выпускные экзамены за курс 7-летней школы и переводные экзамены в 4-6-х и 8-9-х классах. Стала применяться цифровая пяти-бальная система оценки знаний. Были учреждены золотые и серебряные медали для выпускников средней школы.
В условиях войны произошли изменения в составе педагогических кадров, среди которых составляли более 70%. Свыше 180 тысяч учителей ушли на фронт, часть осталась на захваченной территории.
В 1942 году число вузов, готовивших педагогические кадры, сократилось вдвое по сравнению с довоенным периодом. Нехватка учителей приводила к тому, что отдельные предметы в ряде школ не преподавались. По решению правительства учителя, работавшие не по специальности или мобилизованные на производство, стали возвращаться в школы. При всех педагогических учебных заведениях и средних школах стали действовать ускоренные курсы (3-8 месяцев), готовившие преподавателей 1-7 классов. В 1943 году была повышена заработная плата учителям и другим работникам начальной и средней школы и был учрежден почетный знак "Отличник народного образования". Стали восстанавливаться педагогические вузы и училища, возросла численность студентов заочных отделений педагогических вузов.
Признанием значения народного образования и педагогической науки было решение о создании Академии педагогических наук РСФСР, принятое правительством осенью 1934 года.
Большую роль в улучшении совершенствовании учебного процесса сыграли меры по увеличению выпуска и улучшению качества учебников и детской литературы. В тяжелейшие для нее времена страна издавала для детей произведения Пушкина, Лермонтова, Горького, Шекспира, Гете, книги, без которых невозможно приобщение к основам мировой культуры. Вместе с тем страна вынуждена была издавать книги, которые учили детей делать убежища и распознавать самолеты врага, бороться с зажигательными бомбами и оказывать первую помощь при ранениях и ожогах. В октябре 1944 года состоялся первый праздник, положивший начало традиционной неделе детской книги.
Учебный процесс был тесно связан с трудовым. Школьники принимали активное участие в сельскохозяйственных работах. В 1942 году 77 тысяч учащихся старших классов заменили ушедших на фронт механизаторов. За 4 года войны в сельскохозяйственных работах приняло участие более 14,5 млн. учащихся.
Учащиеся всех возрастов участвовали в сборе металлолома, вещевых и продуктовых посылок воинам, помогали ухаживать за ранеными в госпиталях, собирали средства в Фонд обороны страны. В прифронтовой полосе школьники трудились на строительстве оборонительных сооружений, создавали санитарные дружины и отряды связи. 36 тысяч школьников в годы войны были награждены орденами и медалями.
В чрезвычайно сложных условиях работали коллективы ленинградских школ. При каждой школе было от 1 до 6 групп учеников младших классов, которые занимались в бомбоубежищах. В декабре 1941 года положение в школах крайне осложнилось. Не было электричества, дров, керосина. От голода умирали учителя и ученики. К январю 1942 года в младших классах осталось 36 тысяч учеников, а в последующие два месяца их число резко сократилось.
В конце 1941- начале 1942 годов большинство школ вынуждены были прекратить занятия. В зимние месяцы 1941/42 учебного года они продолжались в 39 школах. Чтобы не срывать уроки из-за артиллерийских обстрелов, занятия проводились в бомбоубежищах. Учителя и ученики, не прекращавшие занятий, получали в школе тарелку супа без вырезки талонов из продовольственных карточек.
С 1 по 10 января 1942 года для ленинградских школьников были устроены новогодние елки. На них побывало около 50 тысяч детей.
С мая 1942 года возобновились занятия в 148 школах, в которых насчитывалось более 65 тысяч учеников - практически все школьники, находившиеся в Ленинграде. Многие дети сначала не имели сил, чтобы учиться, и, благодаря регулярному 3-кратному питанию, организованному в школах, они постепенно втягивались в учебу. В 1942 году 10 класс в осажденном городе окончили 542 ученика. Для них 30 июня был устроен общегородской праздник во Дворце пионеров.
Во время 1942/43 учебного года в Ленинграде работали 84 школы, в 863 классах которых учились 26584 ученика. В 1943/44 учебном году число школ достигло 124, и в них занимались 36 тысяч учеников. В 1944/45 учебном году работало уже 200 школ, а число учащихся превысило 100 тысяч.
Свыше 5 тысяч школьников города за активное участие в его обороне было награждено медалью "За оборону Ленинграда".
В самые трудные для страны моменты школа стремилась не только уберечь от опасности, обогреть их, накормить, но и не переставала думать о человеке, который будет жить после войны.