Систематика– это наука, занимающаяся вопросами классификации (распределения) микроорганизмов по группам (таксонам) в соответствии с определенными признаками, их номенклатурой и идентификацией. Под таксоном понимают группу организмов, обладающих заданной степенью однородности.
Основной таксономической единицей в биологии является вид. Вид – это эволюционно сложившаяся совокупность особей одного генотипа, обладающих сходными морфологическими, физиологическими, культуральными, биохимическими и другими признаками. Виды в микробиологии подразделяются на подвиды или варианты, штаммы и клоны. Бактерии вариантов отличаются отдельными своими признаками: морфологическими (морфовары), биологическими (биовары), ферментативными (ферментовары), устойчивостью к антибиотикам (резистенсвары) и бактериофагам (фаговары), антигенной структурой (серовары), патогенностью для определенных хозяев (патовары).
Штамм - это культура микробов, выделенная из определенного источника (организма человека, животного, окружающей среды) разными авторами и в разное время. Клон- культура микроорганизмов полученная из одной особи. Под термином «культура» понимают микроорганизмы, выращенные на жидкой или плотной питательной среде.
Существует два принципа систематики: филлогенетическая, в основе которой лежит установление родственных связей между организмами (систематика высших организмов) ипрактическая (искусственная), целью которой является выявление степени сходства между микроорганизмами для быстрой идентификации и отнесения к определенным таксонам.
В основе современной таксономии микроорганизмов лежат следующие признаки:
1. Морфологические: -форма, окраска по Граму, подвижность, споро- и капсулообразование, размеры;
2. Биохимические: тип метаболизма, ферментация сахаров и многоатомных спиртов, протеолитические свойства и др.
3. Физиологические: отношение к источникам С, О, азота, температуре, рН, влажности;
4. Культуральные признаки: характер роста на плотных и жидких средах;
5. Молекулярно биологические (особенности строения ДНК).
В настоящее время принята международная систематика бактерий по Берги. Берги - американский ученый, возглавивший школу микробиологов, которыми под его руководством была составлена систематика прокариотов. Ее первое издание («Руководство по систематике бактерий») вышло в 1923 г, девятое – I т в 1984 г, 2 т – в 1986, 3 т – в 1989 .
По данной систематике в зависимости от строения клеточной стенки все прокариоты разделены на 4 отдела :
1. Gracilicutes( gracilis - тонкий, стройный, cutes - кожа). В отдел внесены все грамотрицательные микроорганизмы.
2. Firmicutes - ( firmis - крепкий, прочный). В отдел включены грамположительнве кокки, палочки и нити.
3. Tenericutes - (tenes - мягкий, нежный). В отдел включены микоплазмы, у которых отсутствует клеточная стенка.
4. Mendosicutes (mendosi - несовершенная клеточная стенка). Включены микроорганизмы не содержащие муреина и живущие в экстремальных условиях - метанообразующие, сероокисляющие, галофилы, термоацидофильные и др.
После отдела идут следующие таксоны: класс, группа (или секция), порядок (суффикс - ales), семейство ( - ceae ), род, вид.
В микробиологии используется биноминальная номенклатура предложенная К.Линнеем: первое слово обозначает - род и пишется с большой буквы, второе - видовое название и пишется с малой буквы. В название рода включен какой-то морфологический, физиологический признаки или фамилия автора, изучавшего этот род. Название вида - это описание колонии (цвета, ее формы) или источника происхождения.
Примеры: