В XIV веке правящие в Новгороде бояре окончательно превращают былые республиканские органы в органы, где правят представители боярской олигархии. Таким образом, нарушается договор заключенный ранее с иными слоями новгородского общества имевший представительство на должности тысяцкого, в частности. Так, тысяцкий, первоначально избирался из представителей торгово-ремесленного круга и защищал, судя по всему, интересы купцов и ремесленников. Всё это ухудшало социальные взаимоотношения между жителями городской новгородской общины и вело к обострению ситуации.
Не просто складывалась ситуация и во внешней политике Новгорода. Если с могущественным Великим княжество Литовским удалось наладить отношения, то с набирающим силу Московским княжеством дела обстояли непросто.
После победы на Куликовом поле в 1380 году над ханом Мамаем Москва окончательно закрепила собою великокняжеский титул, на который претендовала и Тверь. Для Новгорода такая ситуация означала отсутствие альтернативы в выборе князя, что вело к обострению отношений с Москвой и поиску иных вариантов среди её соперников и врагов.
Усиление соперничества с Москвой при правлении Дмитрия Донского привело к появлению гордого самоназвания Новгорода – Великий Новгород, что должно было уравнять его с титулом «великий князь». Тем временем происходят политические изменения внутри новгородского боярства, происходит объединение его усилий. Причинами таких изменений является отсутствие альтернативы в выборе князя и усиление антибоярских настроений в среде непривилегированного населения Новгорода.
Очередное восстание против бояр в 1418 году привело к новым изменениям в управлении городом. Происходит очередная консолидация боярства, означающая новый формат допуска представителей боярских кланов к власти и управлению городом и его землями.
Так, после восстания 1418 года число посадников было доведено до 24, а в 1463 году и до 36, в том же 1463 году стали избирать и 7-тысяцких. В результате практически каждая боярская семья оказалась прикосновенной к власти. При этом представители этих должностей практически владели ими и могли быть избраны на должность посадника, видимо без особых затруднений.
Итогом реформ XV века, которые расширили число посадников до количества имевшихся в Новгороде боярских семей, стало понижение статуса титула «посадник», а вот звание боярина стало приобретать дополнительное значение.
Появление олигархического по характеру органа государственной власти в Новгороде привело к коренному изменению всей системы взаимоотношений между боярством и иными слоями новгородского населения. Теперь объединенное боярство противостояло всем остальным непривилегированным слоям населения, в отличии от прошлого, когда боярские группировки боролись между собою.
Феодальная война, разразившаяся в Великом княжестве Московском в 1425-1453 году, затронула и Новгород, что только усилило их противостояние. Дмитрий Шемяка, соперник в борьбе за престол ослепленного им князя Василия Темного, бежал в Новгород, где и был отравлен. Отметим, что отравление произошло при помощи подкупленного повара с характерным именем – Поганка.
После этого, в 1456 году Василий Темный совершил поход на Новгород. Новгородцам было запрещено оказывать какую-либо поддержку сыну Дмитрия Шемяки Ивану и его союзнику можайскому князю Ивану Андреевичу.
Отметим, что в 1463 г., новгородцы нарушили этот запрет, что являлось вызовом Москве и разрывом с ней. Тогда же была проведена последняя реформа расширения боярского представительства в высшем органе власти. Такое решительное действие не могло пройти без демонстрации нового единения боярских кланов.
Тем временем, часть новгородской верхушки пыталась перейти под руку короля польского и великого князя литовского Казимира IV. Согласно проектам на стол новгородский приглашался польский король, но при этом провозглашалась независимость православия и неприкосновенность её святынь на новгородской земле. А король польский также пытался добиться новгородского княжения. С этой целью польский король добивался у хана Большой Орды Ахмата союза против Ивана III и признании своих прав на Новгород. В итоге летом 1471 года в Краков прибыло посольство хана Ахмата, и как отмечает, А. Горский с положительным ответом для польского короля.
Новгородская же земля традиционно признавала своим правителем великого князя владимирского, а поскольку этот титул был у правителя Москвы, то и её власть соответственно. В результате московский правитель обвиняет Новгород в уходе под руку польского короля и в отречении от православной веры. Великий князь Иван III ничего не знавший о реакции хана на претензии короля в июле 1471 года совершает поход на Новгород и наносит поражение новгородцам на реке Шелони и вынуждая признать власть Москвы.
Это событие привело также и к походу хана Ахмата в 1472 году, который хотел наказать строптивого вассала, посмевшего нарушить волю татарского хана. Иван III тем временем перестает платить дань Большой Орде и начинает переговоры с крымским ханом против польского короля и хана Ахмата.
Таким образом, отражение похода татарского хана в 1472 и знаменитое стояние на реке Угре в 1480 году считается концом зависимости от Орды. С этого момента Русское государство становится независимым от воли ханов. Так, сложные взаимоотношения с Новгородом стали частью более масштабных и значимых событий – обретение независимости и нового этапа в развитии Русского государства.
А в Новгороде после победы при Шелони московский князь велит казнить инициаторов союза с Казимиром. Но структура боярской власти при этом не терпит каких-либо изменений.
В 1475 году Иван III совершает в этот раз «мирный поход» на Новгород. Князя встретили делегации новгородцев на пути следования. После этого он демонстрировал некую объективность в рассмотрении судебных решений по жалобам жителей Новгорода.
Конец новгородской независимости наступил в 1477 году. Первоначально целью военного похода было отобрать у Новгорода Двинские земли. Но у боярской власти не нашлось защитников и в январе 1478 года московский великий князь утвердил полную власть над древним городом. Вече и посадничество было запрещено, вечевой колокол был увезен в Москву. Московский владыка поклялся не нарушать земельную собственность новгородских бояр, но спустя десять лет клятва была нарушена, и новгородские землевладельцы были переселены под Москву, а в новгородские земли были переселены московские помещики.
Новгородская вечевая республика, превратившаяся со временем в боярскую и олигархическую форму государства, прекратила своё существование.