Многоуровневое строго иерархическое управление не обеспечивает постоянный контроль верхним уровням за непрерывно меняющимися ситуациями на нижнем уровне. Слишком большая дистанция прохождения команд и рапортов об их исполнении. Ситуация меняется быстрее, чем проходят команды. Иерархическое управление создает барьеры между организационными подразделениями и препятствует внутренним потокам информации. Гетерархическая система имеет в своей основе равные права и равную ответственность каждого элемента системы. Равный доступ и доступность друг к другу при строгом соблюдении дисциплины, что в свою очередь требует аккуратного составления правил и целей, формирующих систему. Для ГПС нельзя создать чисто ГАС, т. к. значительное ослабление вертикальных связей не обеспечивает надлежащую последовательность технологических переделов, строго выполнения операционного планирования и соблюдения графика производства. Для ГПС более соответствует матричная система связи с более широкими горизонтальными и более короткими вертикальными связями, т. е. многоуровневая иерархия в управлении со свободной горизонтальной координатой, независимой от уровня иерархии. Это обеспечивает более широкую инициативу в принятии совместных решений персонала разного функционального подчинения.