Несмотря на то, что данные о местоположении файлов хранятся в табличной структуре, пользователю они представляются в виде иерархической структуры. Все необходимые преобразования берет на себя операционная система. К функции обслуживания файловой структуры относятся следующие операции, происходящие под управлением операционной системы:
Создание файлов и присвоение им имен; Создание каталогов (папок) и присвоение им имен; Переименование файлов и каталогов (папок); Копирование и перемещение файлов между дисками компьютера и между каталогами (папками) одного диска; Удаление файлов и каталогов; Навигация по файловой структуре с целью доступа к заданному файлу, каталогу (папке); Управление атрибутами файлов.